受容体の結合サイトの極性/無極性(ホットスポット)を使用すると、効率のよいドッキングを行うことができます。業界標準のCatalystエンジンは、低分子のコンフォメーションを作成して、ドッキングの精度を高めることができます (DS Catalyst Conformation の導入をお勧めします)。DS LibDockは、マルチコアマシンで並列処理を行ったり、仮想ハイ・スループット・スクリーニングに対するクラスターを計算することができます。
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