分子ソフト&インフォマティクス
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分子モデリング・
シミュレーションソフトウェア
Discovery Studio

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Discovery Studioソフトウェア一覧


シミュレーション

分子のエネルギーやダイナミクスを計算

エネルギー最小化を備えたCHARMmのカスタマイズされたバージョン

DNA、RNA、炭水化物、脂質、タンパク質などのモデルを最適化


高分子とリガンド間のエネルギー特性と相互作用

MDトラジェクトリを解析


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高分子設計と解析/抗体モデリング

タンパク質モデリングツール

ホモロジーモデリングツール

対象の配列と既知タンパク質の配列を比較


タンパク質構造のループ領域を最適化

タンパク質ファミリーでの配列保持パターンを解析

タンパク質構造の評価


タンパク質-タンパク質構造の相互作用を予測

タンパク質上の凝集しやすい部位の大きさと場所を特定

分子のエネルギーやダイナミクスを計算


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ストラクチャベースデザイン

CHARMm の正確な受容体サンプリング能力と、効率のよい特性ベースのドッキングを組み合わせ

モンテカルロ法によるリガンドコンフォーマのサンプリングと、リガンドと結合サイトの形状に基づくドッキングを実行

受容体の結合サイトの極性/無極性(ホットスポット)を使用し、効率のよいドッキングを実行


充分に検証され、洗練されたスコアリング関数とその個々の記述子で、リガンド-タンパク質相互作用を評価

フラグメントライブラリからフラグメントの配置やスコアリングを実行

新薬になりうる分子を作成


分子のエネルギーやダイナミクスを計算

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ファーマコフォアモデリングと解析

ターゲットへの結合に必要である基本的な化学的特性や構造的特性の識別が可能

創薬プロセスのごく初期の段階で副作用の可能性を把握可能

コンフォメーションモデルを迅速に算出


データベース検索から化合物を迅速に評価し、優先順位を付けることが可能

受容体の活性サイトによる三次元の空間的制約を満たすことのできる化合物を見出すことが可能

ファーマコフォアを使ってフラグメントの配置を導き出す


Inte:Ligand 社の高品質ファーマコフォアモデルを使用したデータベース


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QSR,ADMEと毒性予測

活性と相関関係にある、多数の分子記述子に簡単にアクセス

ホモロジーモデリングツール

化学ライブラリ設計に特化した、類似性と多様性とを兼ね備えた完全なクラスタリング手法を備えたツール群


化合物を早い段階で評価可能

実験や動物モデルによって化合物の性能を評価可能


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X線

X線構造解析から得られる複雑なデータの解析を支援

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