分子シミュレーション＆インフォマティクス 用語解説

「ドッキング」に関連する分子シミュレーションソフト

DS Analysis: MDトラジェクトリを解析

DS CHARMm: 分子のエネルギーやダイナミクスを計算

DS Flexible Dockin: 正確な受容体サンプリングと、効率よい特性ベースのドッキングを組み合わせ

DS LibDock: 受容体の結合サイトの極性/無極性を使用し、効率のよいドッキングを実行

DS LigandFit: リガンドコンフォーマのサンプリングと、リガンドと結合サイトの形状に基づくドッキングを実行

DS LigandScore: リガンド-タンパク質の相互作用を評価

DS Protein Docking: タンパク質-タンパク質構造の相互作用を予測

DS Protein Refine: タンパク質構造のループ領域を最適化