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分子を構成するすべての原子の原子核が作る場(空間)に、すべての価電子が収まる分子の軌道を求めようとする考え。シュレーディンガー方程式を解くことにより分子の最安定構造やエネルギーを求める。計算手法の違いにより、半経験的分子軌道法と非経験的分子軌道法(ab initio法)がある。
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