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ダイキン工業株式会社

分子シミュレーション&インフォマティクス 用語解説

RMSD  [あーるえむえすでぃー] 

Root Mean Square Deviationの略語。平均二乗偏差。タンパク質構造の非類似性や誤りの指標として使われる。RMSDは対応する2点の距離それぞれを二乗し、その相加平均の平方根として定義されます(標準偏差(SD)は各値と 平均との差の二乗を相加平均し平方根をとったもの)。

「RMSD」に関連する分子シミュレーションソフト

DS Analysis: MDトラジェクトリを解析

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