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超分子・錯体研究向けソフトウェア

MS Visualizer 有機~無機結晶までを構築できる分子モデリングツール

MS Visualizer 有機~無機結晶までを構築できる分子モデリングツール

Crystal, Surface, Layer 構築 ツール

  • 格子パラメータ、原子座標と対称性(空間群)に基づいて周期系構造を作成
  • 広範囲の空間群情報を含む対称性の入力や編集機能
  • 周期系モデルを解析し対称性の詳細情報を表示
  • 対称性に基づいて非周期構造から簡単に表面構造を作成
  • 真空スラブと共に結晶構造から簡単に表面構築を作成
  • 結晶、非結晶マテリアル、それらの組み合わせから層状構造を構築

Polymer Building ツール

  • ホモポリマー、ブロックポリマー、ラ ンダム共重合体やデンドリマーを構築
  • 繰り返し構造(repeat unit)を持った広範囲のライブラリ

MS ForcitePlus 分子動力学シミュレーション Molecular Dynamics (MD)

最新の古典力学計算ツールで、エネルギー計算/構造最適化/動力学シミュレーションが可能。
単純な分子から二次元表面、結晶など三次元周期性構造に至るまで、広い適用性を備えています。

【MS Ver7.0新機能】溶解自由エネルギー計算
【MS Ver7.0新機能】溶解自由エネルギー計算

機能

  • 分子、周期性、結晶構造に対する時間依存性挙動のシミュレーション
  • 多種多様な力場を用いたあらゆる化学系のシミュレーション
  • 表面上および溶液中の分子の容易なシミュレーション
  • 様々な動力学メソッド:
    一定体積、一定エネルギー(NVE)
    一定圧力、一定エンタルピー(NPH)
    一定圧力、一定温度(NPT)
    一定体積、一定温度(NVT)

解析

  • 動力学の実行内容のアニメーション化
  • 実行最中に系のエネルギーをブレイクダウン
  • 温度、圧力、体積、応力、セルパラメーターのプロットおよび解析
  • 動径分布関数および構造因子の計算
  • 平均二乗変位の計算
  • 双極子自己相関関数およびパワースペクトルの計算

詳細はこちら

MS Forcite 分子力学計算シミュレーション Molecular Mechanics (MM)

Dreiding、Universal、CVFF、PCFFパラメータを装備し、高速かつ精度良い解析ツール

MS Forcite 分子力学計算シミュレーションMolecular Mechanics
  • 分子、周期性、結晶構造のエネルギー計算
  • 結晶対称を有する分子、周期性、結晶構造の構造最適化
  • Dreiding、Universal、CVFF、PCFF力場のサポート
  • 電荷平衡法もしくはGasteiger法による電荷の計算
  • 構造最適化のアルゴリズムの選択:
    Steepest Decent、Quasi-Newton、
    Conjugate Gradient、
    ABNRまたはスマートアルゴリズム
  • 周期性の系におけるセル最適化、全てもしくは一部の格子パラメータを最適化可能
  • 外部応力を周期性モデルに適用可能
  • 計算パラメータは様々な精度や個別のカスタマイズが容易に設定可能
  • 収束パラメーター、エネルギー、格子パラメータ、密度は必要に応じて図表としてアウトプット可能

論文紹介

Fluorous Nanodroplets Structurally Confined in an Organopalladium Sphere An M12 (L1)12 (L2)12 Cantellated Tetrahedron: A Case Study on Mixed-Ligand Self-Assembly

MS AmorphousCell 複雑な非晶構造を表現するモデルの構築や重要な物性を予測

広範囲の非晶質系の性質を予測するためのモデルの構成、計算、分析にお使い頂けます。
2つの分子を容易にパッキングすることや密度毎に水分子をパッキングすることができます。

MS AmorphousCell 複雑な非晶構造を表現するモデルの構築や重要な物性を予測

特色として小さい分子からポリマーまで自由に混ぜた混合物系を作り出すツール、ネマチックメソフェーズの作成能力、接着や潤滑の研究に必要な非晶質物のスラブモデルを作り出すツールも組み込まれています。

性質

  • 凝集エネルギー密度・溶解パラメター
  • X線、中性子散乱曲線
  • ガス・小分子の拡散率
    (平均二乗原子置換か速度自己相関関数によって)
  • 赤外線スペクトルと双極子相関関数
  • 弾性スチフネス係数
  • 表面性質

計算

  • バルクモデルのエネルギー極小化
  • 一定の温度、密度あるいは一定の温度、圧力といった他の一般的に考えられる状態下でのPVT関係を予測するための分子力場シュミレーション
  • 潤滑の研究用のずれシミュレーション
  • 分極と誘電作用の研究のためのポーリング
  • 加熱や冷却サイクルに対応する温度サイクルプロトコール

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