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厳選されたデータから描く生体内分子ネットワーク

文献・総説から厳選された分子情報、さらにそれぞれ相互の関連性をネットワーク表示。世界中の研究者の知識が結集したナレッジマネジメントシステムです。これがひとつで大量の文献を調べる手間が省けます。
多彩な検索手法

注目する分子周辺はもちろん、任意の分子間をつなぐネットワークの検索や複数点間共通の上流/下流のネットワーク検索など豊富な検索手法をご用意。検索したネットワーク間の和集合・積集合などの論理演算も可能です。
完全な日本語環境

開発元は株式会社医薬分子設計研究所。完全な日本語環境に加え日本人スタッフによる丁寧なサポートも特長。日本語のほか英語を含む複数の別名にも柔軟に対応し、直感的な検索が行えます。
マイクロアレイデータ解析を高速化

DNAマイクロアレイ等大規模データの分子ネットワークに照らした解析を実現。標準提供の生物情報に加え、実験データや独自データの取り込み、任意ネットワークへのマッピングやネットワーク間の論理演算を利用した解析も可能です。




画面例 クリックすると、拡大画像がご覧いただけます

       

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コンピュータケミストリ
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KeyMolnet

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システム要件



サーバークライアント方式 (サーバーはシステムに含む)
<サーバー>
CPU:Pentium4 3.0GHz以上
メモリ:512MB以上
HDD:80GB以上
OS:Linux
その他:IBM DB2 UDB WorkgroupServer 8.1
オプション:液晶モニタ、無停電電源装置
<クライアント>
OS:Windows 2000、XP
CPU:Pentium4 クラスCPU 1.0GHz以上
メモリ:512MB以上

主な機能



・キーワード入力や実験データから簡単スタート
1つ、または複数のキーワードを入力し合致する生体分子、医薬分子、疾患情報、生体イベントから検索をスタート。実験データや分子・遺伝子IDのインポート、よく知られたパスウェイ名の一覧表からの検索スタートもできます。
・多彩なネットワーク表示
分子ネットワークが最適なレイアウトで描画され、レイアウトの変更も可能です。複合体の構成要素の表示や、表示色の切替えもワンクリックで行なえます。
・項目間のリレーション表示
画面中の任意の個所をクリックし、分子と帰属パスウェイ、分子と生体イベント、疾患メディエート分子(疾患関連分子)と疾患情報、医薬分子とターゲット分子など相互に関連する項目をハイライトして確認できます。さらに、疾患情報については、病態イベント、症状・症候、疾患分類などの情報カテゴリー間の関係も確認できます。
・文献情報表示
パスウェイ、分子リレーション、医薬ターゲット分子等について、収録の根拠となった文献名やPubMed IDが表示されます。
・外部情報の閲覧
蛋白質(SwissProt)、文献(PubMed)等の外部データベースについて、リンク先にジャンプして簡単に閲覧できます。
・自在なネットワーク検索オプション
複数点の周囲のネットワーク検索、複数点間をつなぐネットワーク検索、複数点の共通上流/下流のネットワーク検索などが選択可能です。
・シームレスな分子ネットワークのリアルタイム抽出
任意の生体分子、医薬分子、疾患情報、生体イベント、パスウェイを起点として関係する任意の範囲のネットワークを抽出できます。起点の指定は、ツリービュー/情報ビューの項目かネットワークビュー上のシンボルをクリックして簡単に行なえます。
・ユーザー実験データの解析
DNAマイクロアレイ、プロテオミクス等の多数の分子に関する数値データを読み込み、関与する分子ネットワークを検索しネットワーク図上に数値データをマップして表示・解析できます。

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関連情報

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