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DS Homology Modeling Option |
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Basicに追加し、ホモロジーモデリングを行うためのモジュール群。BLASTによるテンプレートファイルの検索から、自動ホモロジーモデリング、作成された構造の評価を行うことができます。内部で用いているアルゴリズムは、世界的な構造予測コンテストであるCASPで高い評価を得ているアルゴリズムです。
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| 構 成 |
DS MODELER
DS Protein Families
DS Protein Health
DS Sequence Analysis
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DS High throughput docking Option |
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数百から数千の低分子化合物ライブラリに対して、高速にドッキングシミュレーションを行うための追加オプション。
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| 構 成 |
DS Catalyst Conformation
DS LigandScore
DS LibDock
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DS Flexible docking Option |
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タンパク質側鎖のフレキシビリティを考慮した、高精度な全自動フレキシブルドッキングの追加オプション。
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| 構 成 |
DS Catalyst Conformation
DS LigandScore
DS Protein Refine
DS Flexible Docking
DS LibDock
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DS Pharmacophore modeling Option |
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既知の活性リガンドからファーマコフォアモデルを作成、数十万〜数百万件の化合物DBから検索。
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| 構 成 |
DS Catalyst モジュール群
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DS SBP Option |
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タンパク質活性部位の構造から、ファーマコフォアモデルを作成。
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| 構 成 |
DS SBP
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DS de novo Option |
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Ludiのアルゴリズムにより、まったく新規の活性化合物を自動的に構築。
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| 構 成 |
DS Ludi
DS Denovo Evolution
Ludi/CAP
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DS Protein Docking Option |
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国際的なコンテストCAPRIで高い評価を得ているZDOCKアルゴリズムを用いた、タンパクータンパクドッキングツール
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| 構 成 |
DS ProteinDocking
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