ページの本文へ

ダイキン工業株式会社

分子シミュレーション&インフォマティクス 用語解説

ホモロジー  [ほもろじー] [homology]

コンピュータ上で行なうタンパク質の立体構造を予測する手法の一つ。相同なタンパク質(共通祖先を持つタンパク質)は相互に類似した立体構造を持つという経験則基づいており、立体構造が未知のタンパク質の構造を構築する場合、まずそれに相同で立体構造が決定されているタンパク質を探索し、次にその立体構造を鋳型 (テンプレート) として構造が未知のタンパク質の構造を構築し、さらに分子動力学法などにより構造を最適化する。

「ホモロジー」に関連する分子シミュレーションソフト

DS Biopolymer: タンパク質モデリングツール

DS CHARMm: 分子のエネルギーやダイナミクスを計算

DS MODELER: ホモロジーモデリングツール

DS Protein Refine: タンパク質構造のループ領域を最適化

ページの先頭へ