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解析で値を求める要素が解析領域の端にある場合、境界条件を設定する必要がある。境界条件にはいくつかの種類があるが、周期境界条件とは、ある2つの面の値が等しくなるという条件である。流れや温度の分布に周期性(繰り返し)が予想される場合に用いられる。
DS CHARMm: 分子のエネルギーやダイナミクスを計算
GULP: 力場ベースの格子計算プログラム
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